Pawilon akwarium i terrarium to obiekt, którego budowę rozpoczęto w roku 2013, zaś ukończono w sierpniu 2014 roku. Projekt budowy pawilonu akwarium i terrarium powstał dzięki zaangażowaniu władz miasta Bydgoszczy oraz pozyskaniu funduszy na budowę z unijnych środków pomocowych. Całkowity koszt powstania projektu to kwota 6 mln złotych, z których 4 mln złotych przeznaczyło miasto Bydgoszcz, zaś 2 mln złotych pochodziło ze funduszy unijnych Urzędu Marszałkowskiego.

Pawilon akwarium i terrarium to miejsce skupiające jednocześnie rodzimą i egzotyczną faunę saków, ptaków, gadów, płazów, ryb i bezkręgowców. O jego niepowtarzalności świadczy przede wszystkim Wisłarium, czyli ekspozycja składająca się z czterech panoramicznych akwariów dla ryb prezentujących różne odcinki rzeki Wisły, terrariów dla gadów i płazów krajowych oraz wolier dla ptaków związanych ze środowiskiem wodnym.  

W pawilonie znalazły się miejsca dla ekspozycji zwierząt egzotycznych. Liczną kolekcję płazów i gadów egzotycznych skupiono w dużych terrariach siedlisk pustynnego i stepowego oraz lasu deszczowego. Piątym akwarium, zaś jest zbiornik w podłodze o długości ponad 10 m, po którym można chodzić. Ważnym elementem pawilonu jest na pewno wybieg z basenem dla krokodyla. W części środkowej pawilonu znajdują się terraria z różnymi gatunkami bezkręgowców oraz pomieszczenie z latającymi motylami nazywane motylarnią.

Pawilon akwarium i terrarium wyposażony jest także w salę konferencyjną i dydaktyczną, pomieszczenie gastronomiczne, toalety publiczne i sklepik z pamiątkami. Obiekt jest przyjazny dla osób niepełnosprawnych.